ABSTRACT
Resumen Introducción. El virus de la hepatitis C (HCV) presenta una gran variabilidad genética, con siete genotipos y numerosos subtipos. La determinación del tipo viral ha sido fundamental para la escogencia y la duración del tratamiento antiviral adecuado. En Venezuela, el genotipo 2 del HCV es relativamente diverso, siendo particularmente prevalente el subtipo 2j. Objetivo. Evaluar el desempeño de las metodologías para la determinación del genotipo del HCV, particularmente para la identificación del subtipo 2j. Materiales y métodos. Se determinaron el genotipo y el subtipo del HCV mediante la técnica de hibridación inversa LiPA (Line Probe Assay) y secuenciación de las regiones genómicas 5'NC y NS5B del virus. Resultados. En 65 muestras analizadas, la metodología basada en la amplificación de la región 5'NC mostró mayor sensibilidad (100 %), en comparación con la técnica LiPA (91 %) y la secuenciación de la región NS5B (77 %). La determinación de genotipo, tomando como método de referencia la secuenciación de NS5B, mostró un alto grado de concordancia para la secuenciación de la región 5´NC y la hibridación inversa LiPA, con 100 % en la asignación de genotipos, comparado con 70 % y 66 % para los subtipos, respectivamente. La secuenciación de la región NS5B permitió identificar los subtipos 2j y 2s, los cuales no fueron detectados por las otras metodologías. No se observó un patrón característico para las muestras subtipo 2j en la hibridación inversa LiPA. Conclusión. Aunque es la metodología con menor sensibilidad, la secuenciación de la región NS5B es una herramienta poderosa para la correcta discriminación de los distintos subtipos circulantes del HCV, lo cual reviste importancia epidemiológica.
Abstract Introduction: Hepatitis C virus (HCV) displays high genetic variability, with seven genotypes and numerous subtypes. The determination of the viral type has been essential for the selection and timing of antiviral treatment. In Venezuela, HCV genotype 2 is relatively diverse, being particularly prevalent subtype 2j. Objective: To evaluate the performance of methodologies for genotyping HCV, particularly for identification of subtype 2j. Materials and methods: HCV genotype and subtype were determined by reverse hybridization technique (LiPA) and sequencing of the HCV 5'UTR and NS5B regions. Results: A total of 65 samples from HCV-infected patients were analyzed. PCR amplifications of the 5'UTR region exhibited the highest sensitivity (100% vs 91% for LiPA and 77% for NS5B). Genotype determination, taking as reference test NS5B, showed 100% concordance with the other methods, and 67% and 59% for subtypes with 5´NC and LiPA, respectively. NS5B sequencing allowed the identification of subtypes 2j and 2s, which were not detected by the other methods. A specific LiPA pattern was not observed for HCV subtype 2j. Conclusion: Although being the methodology with lowest sensitivity for amplification of HCV RNA, sequencing NS5B region remains a powerful tool for correct discrimination of the different HCV subtypes, which is of epidemiological relevance.
Subject(s)
Humans , Hepacivirus/classification , Hepacivirus/genetics , Genotyping Techniques/methods , GenotypeABSTRACT
La Organización Mundial de la Salud estima que aproximadamente 170 millones de personas están crónicamente infectadas por el virus de la hepatitis C (VHC). En este estudio se evaluó la presencia de anticuerpos contra el VHC en pacientes remitidos durante enero de 2010 a febrero de 2013, al Laboratorio Regional de Salud Pública del Hospital Universitario Antonio Patricio de Alcalá en Cumaná, Venezuela. La presencia de anticuerpos se hizo mediante dos ensayos de ELISA y se determinaron los genotipos circulantes a través de análisis filogenéticos de fragmentos de genoma viral amplificados por la región 5 no codificante (5NC) y región no estructural 5b (NS5b) usando la transcripción reversa y reacción en cadena de la polimerasa en dos rondas (RT-PCR). Se encontró una prevalencia de anticuerpos contra el VHC del 0,57 % (17/3005), siendo el grupo etario mayor de 41 años el más afectado (0,9 %). Un total de 16 muestras resultaron positivas para la presencia del ARN viral por RT-PCR en la región 5´NC (16/17, 94 %). El análisis filogenético de la región 5´NC permitió identificar la circulación del genotipo 2 y 1 y de un genotipo 3 y uno 4. Mediante análisis filogenéticos de la región NS5b, se observó la presencia de diversos subtipos dentro del genotipo 2 (2a, 2j y 2s), lo que concuerda con estudios anteriores que muestran que este genotipo es relativamente diverso en nuestro país.
The World Health Organization estimates that approximately 170 million people are chronically infected with hepatitis C virus (HCV). This study evaluated the presence of antibodies against HCV by two immunoassays. HCV genotypes were analyzed by phylogenetic analysis of viral genome fragments amplified from the 5 non-coding (5NC) region and non-structural region 5b (NS5b), using reverse transcription and nested polymerase chain reaction (RT-PCR), in patients referred from January 2010 to February 2013 to the Reference Laboratory of Public Health, University Hospital Antonio Patricio de Alcalá. The prevalence of anti-HCV antibodies was 0.57% (17/3005), being the group of patients older than 41 years the most affected (0.9%). A total of 16 samples were found positive for HCV RNA by RT-PCR in the 5NC region (16/17, 94%). Phylogenetic analysis of the 5´NC region allowed to identify the circulation of genotypes 2 and 1, and one genotype 3 and one 4. By phylogenetic analysis of the NS5b region, diverse subtypes of HCV genotype 2 were identified (2a, 2j and 2s). This finding is in accordance with previous studies that indicate that this genotype is relatively diverse in our country.
Subject(s)
Adolescent , Adult , Child , Child, Preschool , Female , Humans , Infant , Male , Young Adult , Hepacivirus/genetics , Hepatitis C, Chronic/virology , Phylogeny , Venezuela , Public Health , Genotype , Hospitals, UniversityABSTRACT
La infección por el virus de la hepatitis C (HCV) es común en pacientes hemodializados. Se evaluaron 43 sueros de pacientes de la Unidad de Diálisis Dr. José Maza Carvajal del Servicio Autónomo del Hospital Universitario Antonio Patricio de Alcalá (SAHUAPA), en Cumaná, estado Sucre. Se determinaron anticuerpos IgG séricos contra el HCV (anti-HCV) utilizando tres técnicas inmunoenzimáticas. Para amplificar la región 5 no codificante (5NC) se usó la técnica de transcripción reversa de la reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR), en muestras positivas y negativas para anti-HCV. La presencia de anticuerpos y RNA del HCV fue de 9,3% y la presencia de RNA del HCV en pacientes con anti-HCV negativos fue de 42%, lo cual representó una frecuencia de infección activa de 51%. Análisis filogenéticos de la región 5NC evidenciaron que el genotipo 2 fue el más prevalente, en particular el subtipo 2b, seguido por el genotipo 1, mientras que en siete muestras no se logró identificar el subtipo. La presencia de un alto número de pacientes seronegativos e infectados con el HCV puede deberse al estado de inmunocompromiso de estos pacientes; de allí la importancia de la determinación de la viremia.
Hepatitis C virus infection is common in hemodialysed patients. Sera from 43 patients from the Dialysis Unit Dr. José Maza Carvajal of the University Hospital Antonio Patricio de Alcalá, in Cumana, Sucre state, were evaluated. Antibodies against HCV (anti-HCV) were determined using three immunosorbent assays. The 5 non-coding (5NC) HCV region was amplified by RT-PCR in all samples. The presence of antibodies and HCV RNA was 9.3% and of HCV RNA in seronegative sera 42%, which represents a frequency of infection of 51%. Phylogenetic analysis of the 5NC region showed that genotype 2 was the most frequently found, particularly due to subtype 2b, followed by genotype 1, while seven subtypes could not be determined. The presence of a high number of seronegative HCV-infected hemodialysed patients might be due to the immunocompromised condition of these patients; hence the importance of determining the viremia.
ABSTRACT
Con la finalidad de valorar las características clínicas y parámetros hematológicos en pacientes con fiebre dengue y mononucleosis infecciosa, se evaluó un grupo de 25 y 18 pacientes, respectivamente, con edades comprendidas entre 12 y 40 años que asistieron al ambulatorio "Arquímedes Fuentes Serrano" de la ciudad de Cumaná, estado Sucre, en el período de febrero a octubre del año 2003. Ambas enfermedades fueron diagnosticadas por pruebas inmunoenzimáticas específicas para la detección de anticuerpos de la clase IgM, se aplicó una encuesta a los individuos para considerar datos clínicos y se le determinaron parámetros hematológicos. Los resultados obtenidos fueron analizados mediante métodos de frecuencia simple y t-student. Las principales manifestaciones clínicas de los pacientes con fiebre dengue fueron: fiebre, malestar general, cefalea, escalofríos, dolor retroorbital y osteoartralgia y se encontró leucopenia, neutropenia, linfocitosis relativa y trombocitopenia. Las manifestaciones clínicas más frecuentes en los individuos con mononucleosis infecciosa fueron: fiebre, linfadenopatías, dolor faríngeo, malestar general y cefalea y se encontró neutropenia y linfocitosis. De todos los resultados obtenidos se observó variaciones en la clínica y hematología de los pacientes con fiebre dengue y los que padecen mononucleosis infecciosa
Subject(s)
Humans , Male , Female , Hematologic Agents , Dengue , Fever , Infectious Mononucleosis , Medicine , VenezuelaABSTRACT
Durante el período de junio de 1993 a junio de 1995, se recolectaron 337 muestras de heces de niños menores de cinco años, con diarrea aguda, recluidos en el Hospital Antonio Patricio de Alcalá de la ciudad de Cumaná, Venezuela, y de 89 niños asintomáticos con el mismo rango de edades. A las muestras se les realizó extracción del ARN viral con phenol-cloroformo, precipitación con etanol, electroforesis en geles de poliacrilamida (PAGE) y tinción con plata. Se encontró rotavirus en 116 (30,77 por ciento de las muestras dirreicas y en 7 (7,87 por ciento) de las muestras no diarreicas. A sólo 105 de las muestras dirreicas fue posible observarle un patrón electroforético definido, de las cuales ochenta y cuatro (80 por ciento) presentaron electroferotipo largo; diecinueve (18,09 por ciento) presentron electroferotipo corto; y dos (1,91 por ciento) presentaron una mezcla electroforética. En las muestras no diarreicas se encontró que cinco (71,43 por ciento) correspondían al patrón largo y dos (28,57 por ciento) al patrón corto. Por coelectroforesis se encontraron 7 patrones electroferotípicos distintos; cuatro de patrón largo, dos de patrón corto y una mezcla electroferotípica. Se encontró una correlación inversa significativa (r=-0,5583, p<0,05) entre la prevalencia mensual de rotavirus y la temperatura media mensual y una correlación inversa significativa (r=-0,5724, p<0,05) entre la prevalencia mensual de rotavirus y la precipitación media mensual
Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Climate , Diarrhea , Prevalence , Rotavirus , Epidemiology , VenezuelaABSTRACT
Desde junio de 1993 a junio de 1995 se obtuvieron 377 muestras fecales de niños con diarrea aguda admitidos en el Hospital Antonio Patricio de Alcalá de Cumaná, Venezuela. Se detectaron patrones electroforéticos de rotavirus en 27,85 por ciento (105/377) de las muestras, observándose que los patrones largos (80 por ciento) prevalecieron sobre los otros (18,09 por ciento) y 2 especímenes (1,91 por ciento) exhibieron mezclas de electroferotipos. Por colectroforesis se identificaron 6 patrones electroforéticos diferentes, 4 de patrón largo y 2 patrón corto. Se encontró asociación entre los electroferotipos detectados y las características clínicas de la enfermedad, notándose una duración de la diarrea de 3 a 6 días (73,8 por ciento), la evacuación mínima diaria fue 1 a 2 veces (85,4 por ciento) y la evacuación máxima diaria fue 5 a 8 veces (58,1 por ceinto). La mayoría de los niños mostraron una deshidratación moderada (79,0 por ciento), no tuvieron fiebre (78,1 por ciento) y la duración de los vómitos fue de 1 a 4 días (74,2 por ciento). Estos resultados sugieren que todos los electroferotipos se comportaron de manera similar y por lo tanto no proporcionaron información para establecer la severidad de la infección, por lo que parece improbable que los electroferotipos puedan ser usados para identificar cepas más virulentas de rotavirus.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Diarrhea , Feces , Genome, Bacterial , Rotavirus , Medicine , VenezuelaABSTRACT
Presentamos un caso de fístula gastrocólica secundaria a una úlcera gástrica benigna. Para nuestro conocimiento es el primer caso reportado de la literatura diagnosticada mediante una video-gastroscopia, complementando su evaluación con estudio baritado superior. El tratamiento utilizado consistió en gastrectomía subtotal y cierre primario del defecto colónico. Se realiza la discusión del tema